כתבה
arXiv cs.LG ·
StabilityArc: פיענוח רצפי חלבונים
StabilityArc: Decoding Protein Sequence Embeddings into Generalizable Stability Landscapes
StabilityArc הוא כלי שמפענח רצפי חלבונים לנוף יציבות כללי. הוא משתמש ב-ESMC-600M ו-RoPE transformer כדי לחזות אפקטים של החלפות חומצות אמינו. התוצאות מראות קורלציה גבוהה עם ניסויים אמפיריים.
תקציר מקורי באנגליתarXiv:2610.00742v1 Announce Type: cross Abstract: Every protein has a unique stability landscape, but the physical consequences of mutation are governed by recurring biochemical constraints. We test whether a shared decoder, trained on measurements from diverse proteins, can interpret these constraints in an unseen target, enabling cross-protein transfer for initial experimental round prescreening. We present StabilityArc , which maps frozen ESMC-600M residue representations through a shared RoPE transformer to an Lx20 matrix of substitution effects; a symmetric, contact-aware residual aids in predicting epistasis in simultaneous substitutions. In 66 strict leave-one-protein-out evaluations covering 134,794 ProteinGym variants, StabilityArc achieves 0.7134 Spearman correlation, exceeding t
קרא במקור המקורי
arxiv.org
פתח כתבה מקורית