כתבה
arXiv cs.LG ·
PocketVE: עיצוב תרופות יציב ומונחה תכונות
PocketVE: Stable and Property-Guided Structure-Based Drug Design with Variance-Exploding Diffusion
PocketVE הוא כלי לעיצוב תרופות יציב ומונחה תכונות, המשלב דיכוי קואורדינטות יציב עם הנחיה בזמן אינפרנס. הוא משפר את היכולת לייצר מולקולות 3D תואמות כיס, עם תכונות מולקולריות וגאומטריה פיזית.
תקציר מקורי באנגליתarXiv:2609.08101v1 Announce Type: cross Abstract: Protein-conditioned 3D molecule generation is a central challenge in structure-based drug design, requiring a balance between pocket compatibility, molecular properties, and physical geometry. We propose \textbf{PocketVE}, a protein-pocket-conditioned variance-exploding (VE) diffusion framework that couples stable coordinate denoising with inference-time property guidance. Specifically, PocketVE combines an EDM-style training and sampling setup for 3D denoising, classifier-free guidance for multi-property steering without external property classifiers, and adaptive protein perturbation as a training-time pocket regularizer. Evaluated on CrossDocked2020 under the GenBench3D protocol, PocketVE improves Valid$_{3\text{D}}$ from 58.6 to 80.6 an
קרא במקור המקורי
arxiv.org
פתח כתבה מקורית