כתבה
arXiv cs.LG ·
NEAT-POCKET: ייצור מולקולות 3D בפוקט-קונדישנד
NEAT-POCKET: Pocket-Conditioned Autoregressive 3D Molecular Generation with a Neighborhood-Guided Set Transformer
אי-דרייבן תכנון מולקולות חדשות לגילוי תרופות בשלבים מוקדמים. NEAT-POCKET, פיתוח של המודל NEAT, מפיק מולקולות 3D בסביבת פוקט-קונדישנד. המאמר דן בביצועי המודל וביכולתו לגנרצ' חלקים של מולקולות.
תקציר מקורי באנגליתarXiv:2609.05097v1 Announce Type: new Abstract: AI-driven de novo molecular design offers a promising route to accelerate early-stage drug discovery by generating novel ligands directly within target protein binding pockets. We present NEAT-POCKET, a pocket-conditioned extension of the autoregressive NEAT model for 3D molecular generation. NEAT-POCKET generates molecules atom by atom in protein pocket environments while preserving atom permutation invariance and explicitly modeling hydrogen atoms. Benchmarks on the CrossDocked and SPINDR datasets show that NEAT-POCKET achieves competitive structure-based generation performance while sampling substantially faster than existing baselines. Beyond full-molecule generation, NEAT-POCKET naturally enables pocket-conditioned fragment completion, a
קרא במקור המקורי
arxiv.org
פתח כתבה מקורית