כתבה
arXiv cs.LG ·
ניבוי תגובה של תא תחת פרטורבציה יחידה באמצעות זרימה מונחה על-פי אנרגיה
Generalizable single-cell perturbation response prediction using energy-guided flow matching
ניבוי תגובה של תא תחת פרטורבציה יחידה באמצעות זרימה מונחה על-פי אנרגיה. המאמר עוסק בפיתוח פרקטיקה חדשה לניבוי תגובות של תאים לפרטורבציות, המשתמשת בזרימה מונחה על-פי אנרגיה. הפרקטיקה, שנקראת scEGFlow, מסוגלת לנבא תגובות של תאים לפרטורבציות שאינן נראות במאגרי הנתונים הקיימים. scEGFlow נבחן באמצעות מאגרי נתונים שונים, והתוצאות היו טובות מאלו של פרקטיקות קיימות. המאמר גם כולל תיאור של האלגוריתם של scEGFlow ושל הפרקטיקה שלו.
תקציר מקורי באנגליתarXiv:2610.02232v1 Announce Type: cross Abstract: Predicting phenotypic and transcriptional responses to perturbations at single-cell resolution provides a powerful tool for probing biological systems. However, existing methods typically rely on fixed mappings learned during training, making it challenging to calibrate distribution shifts or adapt to novel perturbation conditions during inference. Here, we present scEGFlow, an energy-guided flow matching framework that dynamically bridges control and perturbed cellular states. scEGFlow models continuous transitions from control cell populations to perturbed states using conditional flow matching. It then applies condition-specific energy gradients to correct and steer these predictions, enabling flexible adjustments without retraining the
קרא במקור המקורי
arxiv.org
פתח כתבה מקורית